Prirojene oziroma kongenitalne motnje lahko vključujejo nepravilen razvoj katerega koli od delov ušesa: zunanjega, srednjega in notranjega ušesa. Nekatere nepravilnosti lahko zdravimo kirurško, zlasti prirojene zunanjega in srednjega ušesa. Za nekatere druge motnje lahko pri rehabilitaciji pomagajo specializirani slušni aparati ali polžkovi vsadki.